在口服液体药用瓶的使用中，我们更关心药用瓶的卫生，尤其是瓶盖。因为饮用时瓶盖经常与我们的嘴直接接触，如果瓶盖上有不干净的东西，就有可能在饮用过程中带入人体。因此，口服液体药用瓶盖的是生产过程中不可或缺的一步。
有以下几种消毒瓶盖的方法：
喷淋式：利用多组喷嘴向多个方向喷射水，对药用瓶盖表面进行。对喷洒时间有一定要求，以保证微生物能被完全杀死。具体地，加盖的药用瓶盖以相同的方向进入瓶盖轨道，轨道的上方和下方设置有多组喷嘴。每组喷嘴可以从不同的角度向药用瓶盖喷射水，喷射出的水不仅对瓶盖进行，还可以推动瓶盖沿着轨道向前运动。
浸泡：就是将口服液体药用瓶的瓶盖浸泡在水中，这样整个瓶盖就可以被水清洗干净了。浸泡时间也取决于消毒水的强度。一般强氧化性水的浸泡时间在10~20秒内即可满足瓶盖完全的时间要求。一种方法是：将方向一致的药用瓶盖固定在瓶盖架上，瓶盖架上连有链条。链条的运动带动瓶盖架进入充满水的池，使瓶盖完全浸泡在水中。药用瓶盖的浸泡时间可以满足瓶盖在10-20秒内完全的时间要求。和喷雾法一样，浸泡在水中的瓶盖也需要无菌水的喷淋洗涤和无菌空气的喷淋洗涤，使液体瓶盖干燥无菌。
